Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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