Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fbxw18Q3TSA9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms