Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CiartQ3TQ03 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms