Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XylbQ3TNA1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XylbQ3TNA1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XylbQ3TNA1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XylbQ3TNA1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XylbQ3TNA1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XylbQ3TNA1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XylbQ3TNA1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XylbQ3TNA1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XylbQ3TNA1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XylbQ3TNA1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XylbQ3TNA1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XylbQ3TNA1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XylbQ3TNA1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XylbQ3TNA1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XylbQ3TNA1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XylbQ3TNA1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XylbQ3TNA1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XylbQ3TNA1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XylbQ3TNA1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XylbQ3TNA1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XylbQ3TNA1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
XylbQ3TNA1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
XylbQ3TNA1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms