Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms