Protein–RNA interactions for Protein: Q3TFD2

Lpcat1, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat1Q3TFD2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lpcat1Q3TFD2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms