Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Zbtb38Q3LR78 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbtb38Q3LR78 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms