Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDF8

Rhox4f, MCG113261, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4fQ2MDF8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox4fQ2MDF8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms