Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam178bQ24JP3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam178bQ24JP3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam178bQ24JP3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam178bQ24JP3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam178bQ24JP3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam178bQ24JP3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam178bQ24JP3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam178bQ24JP3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam178bQ24JP3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam178bQ24JP3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam178bQ24JP3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam178bQ24JP3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam178bQ24JP3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam178bQ24JP3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam178bQ24JP3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam178bQ24JP3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam178bQ24JP3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam178bQ24JP3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms