Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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