Protein–RNA interactions for Protein: Q14DL3

Lrriq3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq3Q14DL3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrriq3Q14DL3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms