Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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ptchd1Q14B62 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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ptchd1Q14B62 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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ptchd1Q14B62 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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ptchd1Q14B62 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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ptchd1Q14B62 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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ptchd1Q14B62 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ptchd1Q14B62 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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