Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Spatc1Q148B6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Spatc1Q148B6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Spatc1Q148B6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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Spatc1Q148B6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Spatc1Q148B6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Spatc1Q148B6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Spatc1Q148B6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Spatc1Q148B6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Spatc1Q148B6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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