Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc162pQ0VG85 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms