Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd12Q0VE29 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms