Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rundc1Q0VDN7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms