Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cntnap5cQ0V8T7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms