Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab42Q0PD08 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms