Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrioQ0KL02 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrioQ0KL02 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms