Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc21bQ0HA38 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc21bQ0HA38 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms