Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700061G19RikQ08EE8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms