Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssrp1Q08943 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms