Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms