Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgm3Q08189 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms