Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CbfbQ08024 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CbfbQ08024 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CbfbQ08024 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CbfbQ08024 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CbfbQ08024 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CbfbQ08024 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CbfbQ08024 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CbfbQ08024 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CbfbQ08024 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CbfbQ08024 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CbfbQ08024 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CbfbQ08024 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CbfbQ08024 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CbfbQ08024 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CbfbQ08024 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms