Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms