Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms