Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms