Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms