Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a1Q04857 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a1Q04857 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a1Q04857 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a1Q04857 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a1Q04857 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a1Q04857 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a1Q04857 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a1Q04857 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a1Q04857 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a1Q04857 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a1Q04857 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a1Q04857 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a1Q04857 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a1Q04857 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a1Q04857 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Col6a1Q04857 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms