Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx2Q04744 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms