Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms