Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Scg2Q03517 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms