Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crisp3Q03402 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms