Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjb4Q02738 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb4Q02738 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms