Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms