Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uba1Q02053 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uba1Q02053 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uba1Q02053 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uba1Q02053 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uba1Q02053 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uba1Q02053 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uba1Q02053 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uba1Q02053 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uba1Q02053 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uba1Q02053 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uba1Q02053 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uba1Q02053 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uba1Q02053 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uba1Q02053 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uba1Q02053 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uba1Q02053 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Uba1Q02053 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uba1Q02053 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uba1Q02053 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uba1Q02053 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uba1Q02053 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uba1Q02053 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uba1Q02053 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uba1Q02053 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uba1Q02053 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uba1Q02053 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms