Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme2Q01768 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms