Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms