Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Top2aQ01320 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Top2aQ01320 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms