Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmgcrQ01237 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms