Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SelpQ01102 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SelpQ01102 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SelpQ01102 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SelpQ01102 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SelpQ01102 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SelpQ01102 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SelpQ01102 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms