Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms