Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp1Q00915 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms