Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SeleQ00690 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SeleQ00690 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SeleQ00690 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SeleQ00690 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SeleQ00690 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SeleQ00690 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms