Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VegfdP97946 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VegfdP97946 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VegfdP97946 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VegfdP97946 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VegfdP97946 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VegfdP97946 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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VegfdP97946 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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VegfdP97946 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VegfdP97946 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VegfdP97946 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VegfdP97946 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VegfdP97946 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VegfdP97946 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VegfdP97946 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VegfdP97946 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VegfdP97946 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VegfdP97946 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
VegfdP97946 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VegfdP97946 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VegfdP97946 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VegfdP97946 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VegfdP97946 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VegfdP97946 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VegfdP97946 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
VegfdP97946 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VegfdP97946 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VegfdP97946 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VegfdP97946 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VegfdP97946 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VegfdP97946 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VegfdP97946 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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