Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcc1P97496 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms