Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmklr1P97468 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms