Protein–RNA interactions for Protein: P97464

Ext1, Exostosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ext1P97464 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ext1P97464 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ext1P97464 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ext1P97464 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ext1P97464 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ext1P97464 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ext1P97464 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ext1P97464 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ext1P97464 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ext1P97464 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ext1P97464 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ext1P97464 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ext1P97464 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ext1P97464 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ext1P97464 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ext1P97464 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ext1P97464 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ext1P97464 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ext1P97464 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ext1P97464 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ext1P97464 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ext1P97464 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ext1P97464 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ext1P97464 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ext1P97464 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ext1P97464 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ext1P97464 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ext1P97464 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ext1P97464 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ext1P97464 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ext1P97464 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ext1P97464 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ext1P97464 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ext1P97464 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ext1P97464 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ext1P97464 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ext1P97464 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ext1P97464 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ext1P97464 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ext1P97464 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ext1P97464 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ext1P97464 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ext1P97464 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ext1P97464 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ext1P97464 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ext1P97464 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ext1P97464 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ext1P97464 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ext1P97464 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ext1P97464 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ext1P97464 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ext1P97464 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ext1P97464 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ext1P97464 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ext1P97464 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ext1P97464 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ext1P97464 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ext1P97464 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ext1P97464 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ext1P97464 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ext1P97464 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ext1P97464 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ext1P97464 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ext1P97464 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ext1P97464 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms