Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms